(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210568286.8
(22)申请日 2022.05.24
(71)申请人 中国科学院深圳先进技 术研究院
地址 518055 广东省深圳市南 山区深圳大
学城学苑大道1068号
(72)发明人 隆晓菁 黄晓娜 高昂 征博文
李宇涵 梁栋
(74)专利代理 机构 深圳市科进知识产权代理事
务所(普通 合伙) 44316
专利代理师 刘建伟
(51)Int.Cl.
G06T 7/00(2017.01)
G06V 10/26(2022.01)
G06V 10/44(2022.01)
G06V 10/82(2022.01)G06N 3/04(2006.01)
(54)发明名称
一种基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方
法及装置
(57)摘要
本发明涉及医学MRI成像领域, 具体涉及一
种基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法及装
置。 该方法及装置首先对胎儿大脑MRI进行数据
增强操作, 再构建基于Contextual Transformer
block的特征金字塔模型: 特征金字塔模型在编
码器和解码器部分引入注意力结构CoT ‑Block,
注意力结构CoT ‑Block利用key上下文信息, 指导
动态注意力矩阵的学习, 增强提取数据增强后的
胎儿大脑MRI图像中的特征; 特征金字塔模型在
解码器部分引入混合膨胀卷积模块, 混合膨胀卷
积模块扩大感受野并且保留详细的空间信息, 并
有效提取医学图像中的全局上下文信息, 从而有
效地提高分割的精度, 最大程度地帮助医生进行
临床诊断。
权利要求书2页 说明书10页 附图2页
CN 115063351 A
2022.09.16
CN 115063351 A
1.一种基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特 征在于, 包括以下步骤:
对胎儿大脑MRI进行 数据增强操作;
构建基于Contextual Transformer block的特征金字塔模型: 所述特征金字塔模型在
编码器和解码器部分引入注意力结构CoT ‑Block, 所述注意力结构CoT ‑Block利用key上下
文信息, 指导动态注意力矩阵的学习, 增强提取数据增强后的胎儿大脑MRI图像中的特征;
所述特征金字塔模型在解码 器部分引入混合膨胀卷积模块, 所述混合膨胀卷积模块扩大感
受野并且保留详细的空间信息, 并有效提取医学图像中的全局上 下文信息;
使用所述特 征金字塔模型对数据增强后的胎儿大脑MRI图像进行组织分割。
2.根据权利要求1所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特征在于, 所述
对胎儿大脑MRI进行 数据增强操作包括:
采用对抗数据增强技术, 通过模拟MRI中常见的伪影造成的强度不均匀性对神经网络
进行训练, 使用训练后的神经网络对胎儿大脑MRI进行 数据增强操作。
3.根据权利要求2所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特征在于, 所述
采用对抗数据增强技术, 通过模拟MRI中常见 的伪影造成的强度不均匀性对神经网络进行
训练包括:
给定一个分割网络fseg(.; θ )和输入图像I, 首先在搜索空间中找到控制点c 的最优值,
对输入图像构建一个对抗偏差场Ibias=Gbias(I; c), 然后通 过神经网络输出原始预测p=fseg
(I; θ )和扰动后的预测p*=fseg(Gbias(I; c); θ ), 通过下式(2)计算Dcomp; 其中Dcomp表示复合距
离函数, 用于增强分割中两种预测之间的辨别能力;
先找到构建偏差场中的控制点c的最优值, 然后再优化神经网络中的参数θ, 使得原始
预测和生成对抗偏差之后的预测fseg(Gbias(I; cadv); θ )之间的距离最小化;
其中, I表示输入图像, θ表示用于训练的网络参数, c是用于构建一个最优偏差场的控
制点, fseg(.; θ )表示分割网络, Gbias(I; c)是一个对抗偏差场, Dcomp表示复合距离函数, p
表示通过神经网络输出的原始预测, p*表示加入了偏 差场之后输出的扰动后的预测, DKL表
示KL散度, Dcontour表示一个基于轮廓的损失函数, w控制两个式子 之间的相对重要性, M表
示前景的通道, Sx,y表示两个sobel滤波器在x和y方向上的边 缘提取。
4.根据权利要求1所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特征在于, 所述
特征金字塔模型由一个主干网络组成, 所述主干网络由编 码器、 解码器、 跳跃连接和特征 组
合四部分组成; 所述解码 器中的每个特征映射与来自所述编码器的对应特征映射相连所形
成的结构为跳跃 连接; 所述跳跃 连接将所述编码器的低级特 征与高级特 征进行相连。
5.根据权利要求4所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特征在于, 所述
编码器和所述解码 器被配置为: 引入用于实现特征提取与利用的注意力结构 CoT‑Block; 所
述注意力结构CoT ‑Block用于利用验证码key上 下文信息, 指导动态 注意力矩阵的学习。
6.根据权利要求5所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特征在于, 所述权 利 要 求 书 1/2 页
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2注意力结构CoT ‑Block被配置为: 首先在验证码key上采用k x k x k的卷积操作来进行编
码, 得到邻近间的上下文信息, 然后将query和上下文信息建模之后的key进行concat, 再使
用两个连续的1 x 1 x 1卷积来得到全局的上下文信息, 最后通过邻近间的上下文信息与
全局上下文信息的融合得到 输出结果。
7.根据权利要求6所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法, 其特征在于, 所述
特征金字塔模型在解码器的最后一层, 引入了混合膨胀卷积模块; 所述混合膨胀卷积模块
在保持参数个数不变的情况下增大了卷积核的感受野, 让每个卷积输出都包含大范围信
息, 同时保证输出的特 征映射的大小保持不变。
8.一种基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割装置, 其特 征在于, 包括:
数据增强单 元, 用于对胎儿大脑MRI进行 数据增强操作;
特征金字塔模型构建单元, 用于构建基于Contextual Transformer block的特征金字
塔模型: 所述特征金字塔模 型在编码器和解码器部 分引入注 意力结构 CoT‑Block, 所述注 意
力结构CoT ‑Block利用key上下文信息, 指导动态注意力矩阵的学习, 增强提取数据增强后
的胎儿大脑MRI图像中的特征; 所述特征金字塔模型在解码 器部分引入混合膨胀卷积模块,
所述混合膨胀卷积模块扩大感受野并且保留详细的空间信息, 并有效提取医学图像中的全
局上下文信息;
组织分割单元, 用于使用所述特征金字塔模型对数据增强后的胎儿大脑MRI图像进行
组织分割。
9.一种存储介质, 其特征在于, 所述存储介质存储有能够实现权利要求1至7中任意一
项所述基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法的程序文件。
10.一种处理器, 其特征在于, 所述处理器用于运行程序, 其中, 所述程序运行时执行权
利要求1至7中任意 一项所述的基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法。权 利 要 求 书 2/2 页
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专利 一种基于深度学习的胎儿MRI脑组织分割方法及装置
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