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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210851851.1 (22)申请日 2022.07.20 (71)申请人 晨星基因 (北京) 智能科技有限公司 地址 100000 北京市海淀区开拓路5号5层 519-30 (72)发明人 高军涛 张旭 (74)专利代理 机构 天津麦芽知识产权代理有限 公司 12269 专利代理师 李淑敏 (51)Int.Cl. B08B 1/00(2006.01) B08B 13/00(2006.01) G16B 15/30(2019.01) G16C 20/50(2019.01) (54)发明名称 一种基于深度学习的药物筛 选方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于深度学习的药物筛 选方法, 包括虚拟筛选机, 所述虚拟筛选机的内 腔底部固定设置有容纳 箱, 所述容纳箱的顶部中 间固定设置有载药台, 所述容纳箱的顶部左右两 侧均开设有落药口, 涉及药物筛选技术领域, 通 过伸缩杆、 弹性通气柱、 衔接杆 以及清洁海绵块 之间的相互配合, 启动抽吸两用泵向弹性通气柱 的内部充入气体, 从而推动伸缩杆变长, 使清洁 海绵块对 载药台表面的药渣进行清洁, 避免残留 的药渣对下一种待筛选的药物造成干扰, 筛选的 准确性提高, 通过承 载框和塑料刮齿之间的相互 配合, 清洁海绵块在收回到放置槽内部的过程中 会经过清刮组件, 塑料刮齿会将清洁海绵块表面 的药渣及时刮下, 保证下次的清洁 效果。 权利要求书1页 说明书4页 附图3页 CN 115228781 A 2022.10.25 CN 115228781 A 1.一种基于深度学习的药物筛 选方法, 其特 征在于: 该 方法包括以下步骤: 步骤一、 建立model ‑1: 建立癌细胞系中药物组合协同作用的预测模型model ‑1; 步骤二、 改造结构: 基于SMI LES提取药物特征、 进行数据增强和 神经网络结构改造; 步骤三、 引入限制条件: 基于表型的药物筛选视角出发, 引入基因表达谱(作为表型)和 分子骨架作为药物 虚拟筛选的限制条件; 步骤四、 构建 model‑2: 构建基因 ‑分子骨架生成模型model ‑2; 步骤五、 数据库筛 选: 以分子骨架为锚点, 对大规模药物数据库进行 药物虚拟筛选; 步骤六、 生成小分子: 药物设计、 生成全新的小分子; 步骤七、 药物虚拟筛选: 在FDA批准的药物库、 ChEMBL药物库和ZINC药物库中对一些癌 细胞系进行基于不同表型的药物组合虚拟筛 选; 步骤八、 验证: 通过靶点预测 和分子对接等手段对这些组合进行验证。 2.一种根据权利要求1所述的基于深度学习的药物筛选装置, 包括虚拟筛选机(1), 其 特征在于: 所述虚拟 筛选机(1)的内腔底部固定 设置有容纳箱(2), 所述容纳箱(2)的顶部中 间固定设置有载药台(3), 所述容纳箱(2)的顶部左右两侧均开设有落药口(4), 所述虚拟 筛 选机(1)的内腔左侧开设有放置 槽(7), 所述 放置槽(7)的内部设置有药渣清洁组件(8); 所述药渣清洁组件(8)包括伸缩杆(81), 所述伸缩杆(81)的内腔左右两侧壁之间固定 设置有弹性通气柱(82), 所述伸缩杆(81)的右端固定设置有衔接杆(83), 所述衔接杆(83) 的底部固定设置有承载板(84), 所述承载板(84)的底部固定设置有清洁海绵块(85), 所述 放置槽(7)的内腔底部右侧固定设置有清刮组件(9), 所述虚拟筛选机(1)的内腔左侧壁开 设有通气腔(10), 所述虚拟筛 选机(1)的左侧固定设置有抽吸两用泵(1 1)。 3.根据权利要求2所述的一种基于深度 学习的药物筛选装置, 其特征在于: 所述容纳箱 (2)的内腔顶部左右两侧均固定设置有两个弹簧(5)。 4.根据权利要求3所述的一种基于深度 学习的药物筛选装置, 其特征在于: 同侧两个所 述弹簧(5)的底部 之间固定 设置有过滤网(6), 所述过滤网(6)位于对应一侧落药口(4)的正 下方。 5.根据权利要求2所述的一种基于深度 学习的药物筛选装置, 其特征在于: 所述清洁海 绵块(85)的底部与载 药台(3)的顶部位于同一水平高度。 6.根据权利要求2所述的一种基于深度 学习的药物筛选装置, 其特征在于: 所述清刮组 件(9)包括承载框(91), 所述承载框(91)的顶部从前到后均匀固定设置有若干塑料刮齿 (92)。 7.根据权利要求2所述的一种基于深度 学习的药物筛选装置, 其特征在于: 所述通气腔 (10)与弹性通气柱(82)的内部相连通, 所述抽吸两用泵(11)的输气端与通气腔(10)的内部 相连通。 8.根据权利要求2所述的一种基于深度 学习的药物筛选装置, 其特征在于: 所述容纳箱 (2)的内部滑动连接有集渣盒(12), 所述集渣盒(12)的内腔上部前后壁之间均匀固定设置 有若干防飞扬板(13)。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115228781 A 2一种基于深度学习的药物筛选方 法 技术领域 [0001]本发明涉及药物筛 选技术领域, 具体为 一种基于深度学习的药物筛 选方法。 背景技术 [0002]药物是用以预防、 治疗及诊断疾病的物质。 在理论上, 药物是指凡能影响机体器官 生理功能及细胞代谢活动的化学物质都属于药物的范畴, 也包括避孕药。 依照法律药物及 国际上分类管 理分为两类: 处方药物及非处方药物(OTC)。 处方药物指那些考虑到医疗安全 只能在医疗监护下使用的药物, 必须由执业医师出具书面处方(例如内科医生、 牙科医生或 兽医)。 非处方药物指那些不用医疗监护即具相当安全性的药物, 可在无 处方情况下由药店 直接出售。 [0003]现有的基于深度学习的药物筛选方法, 在确定有效药物组合的过程中, 需要将待 筛选的药物放置在载药台上进 行操作, 操作好后将药物取走, 载药台表面会残留药渣, 缺乏 相应清理药渣的结构, 会对下一种待筛选的药物造成干扰影响, 导致筛选的准确性降低, 具 有较大的改进空间, 实用性较差 。 发明内容 [0004]针对现有技术的不足, 本发明提供了一种基于深度学习的药物筛选方法, 解决了 在确定有效药物组合的过程中, 需要将待筛选的药物放置在载药台上进行操作, 操作好后 将药物取走, 载药台表面会残留药渣, 缺乏相应清理药渣的结构, 会对下一种待筛选的药物 造成干扰 影响, 导致筛选的准确性降低的问题。 [0005]为实现以上目的, 本发明通过以下技术方案予以实现: 一种基于深度学习的药物 筛选方法, 该 方法包括以下步骤: [0006]步骤一、 建立model ‑1: 建立癌细胞系中药物组合协同作用的预测模型model ‑1; [0007]步骤二、 改造结构: 基于SMILES提取药物特征、 进行数据增强和神经网络结构改 造; [0008]步骤三、 引入限制条件: 基于表型的药物筛选视角出发, 引入基因表达谱(作为表 型)和分子骨架作为药物 虚拟筛选的限制条件; [0009]步骤四、 构建 model‑2: 构建基因 ‑分子骨架生成模型model ‑2; [0010]步骤五、 数据库筛选: 以分子骨架为锚点, 对大规模药物数据库进行药物虚拟筛 选; [0011]步骤六、 生成小分子: 药物设计、 生成全新的小分子; [0012]步骤七、 药物虚拟筛选: 在FDA批准的药物库、 ChEMBL药物库和ZINC药物库中对一 些癌细胞系进行基于不同表型的药物组合虚拟筛 选; [0013]步骤八、 验证: 通过靶点预测 和分子对接等手段对这些组合进行验证。 [0014]本发明还公开了一种基于深度学习的药物筛选装置, 包括虚拟筛选机, 所述虚拟 筛选机的内腔底部固定设置有容纳箱, 所述容纳箱的顶部中间固定设置有载药台, 所述容说 明 书 1/4 页 3 CN 115228781 A 3
专利 一种基于深度学习的药物筛选方法
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