(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210428452.4 (22)申请日 2022.04.22 (71)申请人 河南省农业科 学院 地址 450002 河南省郑州市金 水区农业路1 号 (72)发明人 时夏　周正富　代资举　雷振生　 吴政卿　刘聪聪　车军　 (74)专利代理 机构 郑州联科专利事务所(普通 合伙) 41104 专利代理师 张晓萍 (51)Int.Cl. C12Q 1/6895(2018.01) C12N 15/11(2006.01) A01H 1/04(2006.01) (54)发明名称 小麦钙离 子效应位 点标记qCa.hna as-3D (57)摘要 本申请属于小麦基因工程技术领域， 具体涉 及一个小麦3D染色体上与籽粒钙离子积累连锁 的遗传标记。 该遗传标记命名为SNP1655， 该遗传 标记的第36处碱基存在一个36C ‑36T的等位基因 突变。 本申请中， 基于高密度SNP芯片基因型鉴定 结果， 结合全基因组关联分析技术， 发明人初步 鉴定获得了一个影响小麦籽粒钙离子积累遗传 位点相关的SNP位点。 分析表明， 该位点存在一个 C→T突变， 当该位点为CC时， 相比较于CT(Y)基因 型具有更高的小麦籽粒钙离子含量， 说明CC基因 型是控制小麦籽粒钙离子积累的优势单倍型， 为 提升小麦籽粒钙离子含量的有利等位基因。 可为 高钙离子含量小麦育种技术奠定一定理论基础 和技术基础。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图2页 CN 115029467 A 2022.09.09 CN 115029467 A 1.小麦钙离子效应位点标记qCa.hnaas ‑3D， 其特征在于， 将该遗传标记命名为： SNP1655， 其核苷酸序列如下 所示： GTTTTCTTCGCAAAAAAGTGCTGGTAACTCTTCCT[C/T]TTTTAACATTCCCCAAGTTGCCAAATCTAGAG CTC； 该遗传标记的第3 6处碱基存在一个3 6C‑36T的等位基因突变； 具体而言： 高钙CC基因型的遗传标记序列如SEQ  ID No.1所示， 具体如下： GTTTTCTTCGCAAAAAAGTGCTGGTAACTCTTCCTCTTTTAACATTCCCCAAGTTGCCAAATCTAGAGCTC 。 2.权利要求1所述小麦钙离子 效应位点标记qCa.hnaas ‑3D在小麦籽粒钙含量检测中应 用， 其特征在于， 通过检测其3 6处碱基位 点来判定小麦 籽粒钙离 子含量； 如果两条3D染色体对应位点的第36位碱基均为C， 则小麦品种属于高钙CC基因型小麦 品种， 小麦 籽粒具有高钙离 子含量。 3.权利要求1所述小麦钙离子效应位点标记qCa.hnaas ‑3D在小麦新品种培育中应用， 其特征在于， 利用分子标记育种技术， 通过检测该遗传标记第36位碱基序列， 用于培育高钙 含量小麦新品种。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 115029467 A 2小麦钙离子效应位点标记qCa.h naas‑3D 技术领域 [0001]本申请属于小麦基因工程技术领域， 具体设计一个小麦3D染色体上与籽粒钙离子 积累连锁的分子 遗传标记。 背景技术 [0002]小麦(Triticum  aestivum L.)作为世界三大粮食作 物之一， 约占我国口粮消费的 40%， 其产品是居民的主要 营养物质来源。 因此， 小麦品质改良和育种技术提升， 对于我国粮 食安全具有十分重要的技 术意义。 [0003]钙离子是人体必须的微量元素， 在维持机体正常生理生化功能方面扮演着重要角 色。 截至目前， 由于钙离子缺乏引起的与微量元素营养不良相关的疾病， 已导致全球至少20 亿人口面临健康威胁， 世界卫生组织将此种微量元素缺乏现象定义为 “隐性饥饿 ”， 是引起 人体机能障碍和多种疾病的重要原因之一。 利用生物强化育种 方法， 提高主要粮食作物微 量元素含量， 改善人体微量元素摄入量， 被认为是解决人体微量元素缺 乏的最有效策略之 一。 [0004]已有研究表明， 小麦籽粒中的钙离子含量是一种典型的数量性状， 受多基因控制。 利用传统育种手段开展籽粒高钙离子小麦种质资源筛选和 新品种选育， 具有选择效率低、 周期长、 稳定性差等特点。 因此， 如果能够较早的在田间对小麦籽粒的钙离子含量进行预 测， 可有效提高籽粒高钙离子含量小麦新品种的选育效率。 SNP （Single ‑Nucleotide   Polymorphisms） 这种在基因组水平上由单核苷 酸变异引起的序列多态 性， 可以最大限度的 代表不同个体之 间的遗传差异， 是研究复杂数量性状的重要遗传标记。 因此， 鉴定获得与小 麦籽粒钙离子积累遗传位点紧密连锁的SNP标记， 并结合分子标记辅助育种技术， 有望提高 小麦籽粒高钙离 子含量新品种的选 育效率， 快速高效的服 务于育种实践。 发明内容 [0005]基于小麦基因组解析， 本申请目的在于提供一个小麦3D染色体上与籽粒钙离子积 累连锁的遗传标记， 从而为高钙离 子含量小麦新品种培 育奠定一定技 术基础。 [0006]本申请所采取的技 术方案简述如下。 [0007]小麦钙离子效应位点标记qCa.hnaas ‑3D ， 将该遗传标记命名为： SNP1655 （QTL   qCa.hnaas ‑3D） ， 参考小麦 “中国春”基因组v1.1版序列， 其位于小麦3D染色体； 其核苷酸序 列 （71bp） 如下 所示： GTTTTCTTCGCAAAAAAGTGCTGGTAACTCTTCCT[C/T]TTTTAACATTCCCCAAGTTGCCAAATCT AGAGCTC； 该遗传标记的第36处碱基存在一个36C ‑36T的等位基因突变， 该突变导致该基因 序列产生了核苷酸多态性， 进 而使得小麦 籽粒具有不同的钙离 子含量表型； 具体而言： 当该位点为CC纯合型时， 相比较于CT(Y)基因型， 小麦籽粒具有更高的钙离子含 量， 此时小麦品种属于高钙型；说　明　书 1/5 页 3 CN 115029467 A 3