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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210518487.7 (22)申请日 2022.05.12 (71)申请人 山西农业大 学 地址 030031 山西省太原市小店区龙城大 街81号 申请人 山西省畜牧技 术推广服 务中心 (72)发明人 史明月 路畅 刘巧霞 曹果清 杨帅 李文霞 张燕伟 员佳乐 杨阳 蔡春波 高鹏飞 李步高 (74)专利代理 机构 北京路浩知识产权代理有限 公司 11002 专利代理师 黄爽 (51)Int.Cl. C12N 15/113(2010.01) C12Q 1/6888(2018.01)C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6851(2018.01) (54)发明名称 与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的IncRNA及 其应用 (57)摘要 本发明提供一种与猪骨骼肌卫星细胞增殖 相关的IncRNA及其应用。 本发明基于 前期转录组 测序数据, 发现IncRNA Loc106505926随日龄的 增长其表达量极显著下降, 通过PCR试验证明 Loc106505926客观存在; 进 一步通过实时荧光定 量PCR及EdU染色试验验证了Loc106505926在猪 骨骼肌卫星细胞增殖过程中的作用, 发现干扰 Loc10650592 6后增殖标志基因PCNA、 Ki67等 极显 著降低, 阳性细胞数极显著减少。 本发明提出 Loc106505926可作为生物标志物用于鉴定猪骨 骼肌卫星细胞的增殖情况, 为肌肉生长发育的研 究提供新思路。 权利要求书1页 说明书6页 序列表5页 附图3页 CN 115161318 A 2022.10.11 CN 115161318 A 1.与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的IncRNA, 其特征在于, 所述IncRNA对应 的cDNA序列 如SEQ ID NO:1所示。 2.权利要求1所述IncRNA作为猪骨骼肌卫星细胞增殖的标志物在制备用于鉴定猪骨骼 肌卫星细胞增殖的检测试剂或试剂盒中的应用。 3.用于检测权利要求1所述IncRNA的引物, 其特征在于, 包括如SEQ ID NO:2所示的上 游引物和如SEQ ID NO:3所示的下游引物。 4.用于鉴定猪骨骼肌卫星细胞增殖的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒包括用于检测 权利要求1所述 IncRNA表达水平的试剂。 5.根据权利要求4所述的试剂盒, 其特征在于, 所述试剂盒包括SEQ ID NO:2‑3所示引 物。 6.权利要求1所述IncRNA的抑制剂, 其特征在于, 所述抑制剂为SEQ ID NO:8‑9、 SEQ ID NO:10‑11或SEQ ID NO:12‑13所示的siRNA, 或者上述 三对siRNA的组合。 7.一种鉴定猪骨骼肌卫星细胞增殖效率的方法, 其特征在于, 所述方法包括: 检测猪骨 骼肌卫星细胞中权利要求 1所述IncRNA的相对表达水平, 与对照组相比, 若所述IncRNA的相 对表达水平低, 则表明猪骨骼肌卫星细胞增殖效率低。 8.根据权利要求7所述的方法, 其特征在于, 利用SEQ ID NO:2‑3所示引物检测所述 IncRNA的表达水平。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115161318 A 2与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的IncRNA及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及分子遗传技术领域, 具体地说, 涉及一种与猪骨骼肌卫星细胞增殖相 关的IncRNA及其应用。 背景技术 [0002]骨骼肌是哺乳动 物体内最丰富的组织, 除了负责机体的运动, 还具有产生热量、 储 存蛋白质、 支持和保护软组织等功能。 作为 维持机体运转的重要器官之一, 骨骼肌与畜禽的 产肉量以及改善肉品质等经济性状密切相关。 骨骼肌的发育过程复杂, 受多种因子的调控, IncRNA是其中的重要调节因子 。 [0003]作为非编码RNA中的重要成员, Inc RNA广泛存在 于多种生物体内, 其功能涉及 到细 胞生命活动和个体发育等各个方面。 IncRNA是一类在真核生物体内主要由RNA聚合酶 Ⅱ指 导转录而成并且长度大于200nt的ncRNA, 大部分IncRNA表现出与 mRNA相似的结构特点, 其 序列中含有启动子、 外显子和内含子, 5 ′端和3′端经过加工和修饰后有5 ′帽子和3′polyA 尾, IncRNA序列保守性较低, 只有约12%的人基因组编码的IncRNA可以在其它生物中找到, 许多IncRNA都具有保守的二级结构, 一定的剪切形式以及亚细胞定位; 同时IncRNA的表达 也具有时空特异性。 这种保守性和特异性表明它 们是具有功能的。 [0004]根据IncRNA在基因组上相对于蛋白编码基因的位置, 可以将其分为反义型 IncRNA、 基因间型IncRNA、 发散型IncRNA、 增强子型IncRNA, 内含子型IncRNA这5种类型。 近 年的研究表明, IncRNA能在表观遗传、 转录及转录后水平上等多个层次调控基因的表达, 表 观遗传学层面是通过染色质重塑、 DNA甲基化和组蛋白修饰等方法, 使基因功能发生改变; 转录水平调控 是IncRNA可以通过调节相 邻基因的转录、 调节转录因子、 与DNA形成三螺旋复 合物等形式进行基因调控; 在转录后水平上, IncRNA除了能与剪接因子相互作用影响pre ‑ mRNA的剪接或与靶mRNA碱基特异性互补配对形成双链结构来调控基因以外, 还能作为 ceRNA竞争性结合miRNA来调控基因的表达。 除此之外, IncRNA还参与了X染色体沉默、 基因 组印记、 胚胎发育、 脂肪代谢调控、 骨骼肌生长发育以及染色质修饰等重要的调控过程。 目 前IncRNA的调控作用研究多集中在 小鼠等模式动物上, 猪骨骼肌中IncRNA的功能及其调控 机制还需进一 步探究。 发明内容 [0005]本发明的目的是提供一种与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的I ncRNA及其应用。 [0006]为了实现本发明目的, 第一方面, 本发明提供一种与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关 的IncRNA(Loc106505926), 所述 IncRNA对应的cDNA序列如SEQ ID NO:1所示。 [0007]第二方面, 本 发明提供所述Inc RNA作为猪骨骼肌卫星细胞增殖的标志物在制备用 于鉴定猪骨骼肌卫星细胞增殖的检测试剂或试剂盒中的应用。 [0008]第三方面, 本发明提供一对用于检测所述IncRNA的引物, 包括如SEQ ID NO:2所示 的上游引物和如SEQ ID NO:3所示的下游引物。说 明 书 1/6 页 3 CN 115161318 A 3
专利 与猪骨骼肌卫星细胞增殖相关的IncRNA及其应用
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