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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210521337.1 (22)申请日 2022.05.13 (71)申请人 苏州大学 地址 215000 江苏省苏州市吴中区石湖西 路188号 (72)发明人 甄晓媛 赵文锋 李立娟 高玉振 (74)专利代理 机构 苏州市中南伟业知识产权代 理事务所(普通 合伙) 32257 专利代理师 王玉仙 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 基于METT L16基因多态性位点预测心源性猝 死的分子标记及试剂盒 (57)摘要 本发明涉及一种基于METT L16基因多态性位 点预测心源性猝死的分子标记及试剂盒, 分子标 记为METTL16基因的rs58928048位点, 该位点插 入或缺失碱基TGTCTG, 插入型指示心源性猝死 发 病风险高。 本发明通过对METTL16基因的 rs58928048位点的插入缺失多态性与心源性猝 死表型相关性的研究, 提供了一种与心源性猝死 相关的多态 性分子标记, 并进一步提供了一种心 源性猝死检测试剂盒, 从而 得到检测个体的心源 性猝死发病风险。 权利要求书1页 说明书4页 序列表1页 附图1页 CN 114736960 A 2022.07.12 CN 114736960 A 1.一种检测心源性猝死发病风险的插入缺失多态性分子标记, 其特征在于: 所述插入 缺失多态性分子标记为M ETTL16基因的rs589 28048位点, 该位点插入或缺失碱基TGTCTG。 2.根据权利 要求1所述的插入缺失多态性分子标记, 其特征在于: 插入碱基TGTCTG指示 心源性猝死发病风险高。 3.METTL16基因插入缺失多态性位点在制备心源性猝死检测试剂盒中的应用, 其特征 在于: 所述心源性猝死检测试剂盒用于检测M ETTL16基因rs589 28048位点的基因型。 4.根据权利要求3所述的应用, 其特征在于: 所述心源性猝死检测试剂盒中包括扩增 METTL16基因rs589 28048位点的引物。 5.根据权利要求4所述的应用, 其特征在于: 扩增METTL16基因rs58928048位点的引物 包括有义引物和反义引物, 所述有义引物的核苷 酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述反义引物 的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 6.根据权利要求3所述的应用, 其特征在于: 所述心源性猝死检测试剂 盒中还包括用于 PCR扩增和毛细管电泳的组件。 7.扩增METTL16基因rs589 28048位点的引物在制备心源性猝死检测试剂盒中的应用。 8.根据权利要求7所述的应用, 其特征在于: 扩增METTL16基因rs58928048位点的引物 包括有义引物和反义引物, 所述有义引物的核苷 酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述反义引物 的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 9.一种基于METTL16基因插入缺失多态性的心源性猝死检测试剂盒, 其特征在于: 所述 心源性猝死检测试剂盒用于检测METTL16基因rs58928048位点的基因型, 包括用于扩增 METTL16基因rs589 28048位点的引物。 10.根据权利要求9所述的心源性猝死检测试剂盒, 其特征在于: 所述引物包括有义引 物和反义引物, 所述有义引物的核苷 酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述反义引物的核苷 酸序 列如SEQ ID NO.2所示。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114736960 A 2基于METTL16基因多态性位点预测心源性猝死的分子标记及 试剂盒 技术领域 [0001]本发明涉及生物技术领域, 尤其涉及一种基于METTL16基因多态性位点预测心源 性猝死的分子标记及试剂盒。 背景技术 [0002]心源性猝死(sudden cardiac death, SCD)是指由心脏原因引起的突发性的非预 料死亡, 表现为短期内发生的突 发意识丧失及循环、 呼吸骤停。 “短期”规定为有目击者情况 下小于1小时内, 无目击者时则为2 4小时。 以往 大量研究表明, SCD的死因多为冠状动脉粥样 硬化性心脏病或致命性心律 失常。 前者多 见于高龄人群, 后者则多 见于年轻人。 考虑到死后 的尸体解剖和组织学检查难以找到准确的死因, 为了能准确诊断SCD, 揭开SCD发生的分子 机制、 寻找SCD的遗传标记迫在眉睫。 [0003]过去针对SCD诊断领域的研究主要集中于对重要蛋白编码基因的编码区突变与猝 死的关联性分析, 然而相关的突变不仅数量有限, 普通群体极低的基因频率难以完全解释 相对而言较高的猝死发生率。 随着全基因组关联研究及二代测序技术的发展, 越来越多的 遗传标记被发现参与SCD的调控。 SCD遗传标记的识别能够进一步深入了解其潜在机制, 优 化SCD的风险分层, 并为分子诊断和预防提供强有力的理论依据。 考虑到3'UTR对基因表达 起到重要的调控作用, 我们把 目光投向了这片区域内的遗传多态, 通过病例对照研究分析 相关基因中3'UTR的遗传多态性与SCD的易感性之间的关联, 为建立可用于SCD风险评估的 基因多态性检测体系提供了可能。 [0004]N6‑甲基腺苷(m6A)是真核细胞中最普遍和最丰富的内部转录后RNA修饰类型, 由 其效应蛋白甲基转移酶(METTL16、 METTL3、 METTL14等), 去甲基酶(FTO、 ALKBH5等), 和相关 结合蛋白(YTHDF1 –3)可逆地、 动态的调节。 m6A在基因表达调节、 mRNA稳定性和稳态、 各种疾 病等中发挥着重要作用。 随着科学技术的发展, 越来越多的研究发现m6A相关蛋白基化异常 是心血管疾病发展的标志, 包括心肌肥厚、 心力衰竭、 心肌梗塞、 缺血性心脏病、 主动脉瘤、 血管钙化、 肺动脉高压等。 同时使用全基因组关联研究(GWAS)也已经确定了许多与心血管 病相关的m6A ‑SNPs, 并探索了遗传功能机制。 如 rs9847953和rs197922 被鉴定为潜在的功能 变异, 有助于调节血压。 还有研究表明rs12286在机制上可能影响m6A的甲基化水平, 并与 SCD显著相关。 总的来说, m6A甲基化调控对维持心脏生理功能至关重要, m6A修饰可能有助 于进一步认识心血管发病机制的分子 机制, 并可能成为未来潜在的生物标志 物。 [0005]METTL16是一种新的m6A甲基转移酶, 包含I类甲基转移酶的Rossm ann样折叠, 通过 调节SAM合成酶或者其他因子参与 m6A修饰。 研 究表明METTL16在肿瘤(如肝癌)的发生发展 中发挥了重要的促癌基因的作用。 MetTLL16低表达也已在卵巢癌中确定(OC), 且METTL16介 导的RNA结构甲基化是小鼠胚胎发育过程中的重要参与者, 另外有猜测表明MetT16/Malat1 相互作用可能与血 管生成有关。 [0006]现有技术中, 并没有对rs58928048插入缺失多态与SCD相关性的研究报道, 也没有说 明 书 1/4 页 3 CN 114736960 A 3
专利 基于METTL16基因多态性位点预测心源性猝死的分子标记及试剂盒
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