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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210548632.6 (22)申请日 2022.05.20 (71)申请人 华南师范大学 地址 510631 广东省广州市天河区中山大 道西55号华南师范大学 (72)发明人 周小明 林梅 (74)专利代理 机构 广州市华学知识产权代理有 限公司 4 4245 专利代理师 郭炜绵 (51)Int.Cl. C12Q 1/6844(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种添加剂辅助的一管核酸检测方法 (57)摘要 本发明公开了一种添加剂辅助的一管核酸 检测方法, 该方法包括以下步骤: 将核酸检测反 应液加入反应管底, 将核酸扩增反应液加入同一 反应管的管壁, 短暂离心使管壁上的反应液下沉 与管底反应液接触 混合, 检测反应管中的荧光信 号; 所述的核酸检测反应液中含有甘油, 甘油占 反应体系的体积百分比为10 ‑20%。 相对于分步 反应体系, 本发 明的检测方法达到相同的检测灵 敏度, 同时又避免了气溶胶污染的产生, 简化了 实验步骤。 相对于基于物理分离的一管反应体 系, 本发明的检测方法简化了实验操作步骤。 相 对优化Cas反应体系, 本发明的检测方法仅用一 条引导RNA即可实现高灵敏度的核酸检测, 简化 了反应体系。 权利要求书1页 说明书5页 附图2页 CN 114908144 A 2022.08.16 CN 114908144 A 1.一管核酸检测方法, 其特 征在于包括以下步骤: 将核酸检测反应液加入反应管底, 将核酸扩增反应液加入 同一反应管的管壁, 短暂离 心使管壁上的反应液 下沉与管底反应液接触混合, 孵 育并检测反应管中的荧 光信号; 所述的核酸检测反应液中含有甘油, 甘油占反应体系的体积百分比为10 ‑20%; 所述的 反应体系包括核酸检测反应液和核酸扩增反应液。 2.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述甘油占反应体系的体积 百分比为15%。 3.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述核酸检测反应液与核酸 扩增反应液的体积比为1:(0.1 ‑10)。 4.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述孵育是在温度25 ‑65℃ 下进行。 5.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述的核酸检测反应液中含 有荧光报告探针、 crRNA、 Cas蛋白和反应缓冲液。 6.根据权利要求5所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述的核酸检测反应液中, 荧光报告探针的终浓度为20 0nM‑1uM。 7.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述核酸扩增反应液包括扩 增引物、 扩增所需的蛋白酶、 扩增缓冲液, 和包 含靶标核酸的待测物。 8.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述的核酸扩增反应液是以 下核酸扩增类型的反应 体系: 重组酶聚合酶等温扩增(RPA)、 依赖核酸序列扩增(NASBA)、 重组酶介导等温核酸扩增 (RAA)、 转录介导的扩增(TMA)、 依赖解旋酶恒 温扩增(HDA)、 链置换扩增(SDA)、 环介导等温 扩增(LAMP)、 嵌合体置换反应(RDC)、 核酸等温嵌合扩增(ICAN)、 线性等温聚合扩增(LIMA)、 智能扩增过程(SMAP)、 双引物等温扩增(DAMP)、 自我延伸扩增(SEA)、 滚环扩增(RCA)、 指数 等温扩增(EXPAR)或单引物等温扩增技 术(SPIA)。 9.根据权利要求8所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述重组酶聚合酶等温扩增 的反应体系包括单链DNA结合蛋白(S SB)、 重组酶和链置换聚合酶。 10.根据权利要求1所述的一管核酸检测方法, 其特征在于: 所述核酸检测反应液是以 下检测系统的反应 体系: V型CRISPR/Cas检测系统、 生物发光检测系统、 比色检测系统或电化学检测系统。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114908144 A 2一种添加剂辅助的一管核酸检测方 法 技术领域 [0001]本发明属于生物检测领域, 具体涉及一种添加剂辅助的一管核酸检测方法。 背景技术 [0002]目前, CRISPR/Cas系统, 如CRISPR/Cas12和CRISPR/Cas13系统, 因其特异性、 可编 程性和易用性等优点已被广泛地应用于核酸检测领域。 然而, 单独的CRISPR ‑Cas检测体系 灵敏度仍难以满足临床的分析要求。 因此目前基于CRISPR/Cas技术的核酸检测方法绝大多 数是与核酸扩增技 术相结合的。 [0003]在基于核酸扩增与CRISPR/Cas系统的一管核酸检测方法中, 由于CRISPR/Cas体系 能识别并降解扩增靶标, 导致扩增模板缺失, 所以扩增效率大大降低。 此外, 被靶标核酸激 活的CRISPR/Cas系统能够非特异地降解核酸扩增所需的引物, 进而导致扩增效率下降。 这 些因素导致现有的基于核酸扩增与CRISPR/Cas技术相结合的一管方法检测效率低下, 不能 满足高灵敏的核酸检测要求。 [0004]为了解决上述问题, 很多研究将CRISPR/Cas检测与核酸扩增两个过程分开进行, 尽管能实现灵敏度的提升但其检测程序涉及到扩增产 物的转移, 这容易造成气溶胶污染进 而导致假阳性的检测结果。 发明内容 [0005]为了克服现有技术的缺陷, 本发明的目的在于提供一种添加剂辅助的一管核酸检 测方法。 [0006]本发明的目的通过 下述技术方案实现: [0007]一管核酸检测方法, 包括以下步骤: [0008]将核酸检测 反应液加入反应管底, 将核酸扩增反应液加入同一反应管的管壁, 短 暂离心使管壁上 的反应液下沉与管底反应液接触混合(接触后逐渐混合, 未混匀), 孵育并 检测反应管中的荧 光信号; [0009]所述的核酸检测反应液中含有甘油, 甘油占反应体系的体积百分比为10 ‑20%, 优 选15%; 所述的反应 体系包括核酸检测反应液和核酸扩增反应液; [0010]所述的核酸检测反应液中含有荧光报告探针, 其终浓度为200nM ‑1uM, 以保证靶标 核酸附近存在充足的荧 光报告探针可被切割; [0011]所述的核酸检测反应液中还含有终浓度10 ‑500nM的crRNA、 终浓度10 ‑500nM的Cas 蛋白和反应缓冲液; [0012]所述核酸检测反应液与核酸扩增反应液的体积比为1:(0.1 ‑10); [0013]所述孵育是在温度25 ‑65℃下进行; [0014]所述核酸扩增反应液包括终浓度120 ‑480nM的扩增引物、 扩增所需的蛋白酶、 扩增 缓冲液, 和包 含靶标核酸的待测物; [0015]所述的核酸扩增反应液 可以是以下核酸扩增类型的反应 体系:说 明 书 1/5 页 3 CN 114908144 A 3
专利 一种添加剂辅助的一管核酸检测方法
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